作为太阳能光热领域两大平分秋色的应用系统，平板与真空管的性能各有千秋。
　　在防冻性能方面，平板太阳能集热器本身无法防冻，温度低于0℃的区域，集热器及管路需考虑防冻。为避免这一问题，平板太阳能可采用恒温混水阀，实现定温出水，或采用循环水泵和在闭式集热铜管中使用防冻液来进行温差循环，采用防冻液的集热系统甚至可以在零下35℃的低温下提供澎湃的生活热水。真空管太阳能集热器采用双层高膨硅玻璃真空保护，集热器本身具有很好的防冻性能，但在温度低于0℃的地区需考虑管路防冻，一般采用电伴热带防冻。
　　虽然在防冻性能方面，真空管集热器比平板略显优势，但在解决夏季过热问题上，真空管又不如平板集热器。真空管集热器本身和系统无法解决夏季过热问题，在夏季高温天气，真空管的温度高达80℃，既影响了使用寿命，又容易导致水温过高引发的烫伤。而平板集热器系统采用排空技术，集热器中无介质，可很好地解决夏季过热问题。
　　由于平板太阳能比真空管太阳能实际采光面积多30﹪~40﹪，因此在热效率性能上，平板系统比真空管略高（平板52.5%，真空管47%）。由于平板的散热面积大，保温性能比真空管太阳能差，需要用水泵把太阳能集热热量及时转移到水箱内保温，有一定的耗电性，每日约在0.2~0.3度。真空管散热面积小，可以360度跟踪太阳能光，在冬天及多云等天气条件下，性能比平板占优势，但集热面积利用率不如平板太阳能。
　　在是否结垢性能上，平板比真空管优势明显：平板式集热器可排污，不易结垢；真空管下端密封，易形成水垢，造成热水器效率降低热效率，且易导致水位传感器与电磁阀等电子元器件发生故障，使热水器可靠性进一步下降。虽然如此，真空管热水器的水垢很容易排除，直接倒出即可，而平板式是金属管路，一旦由于水质差等问题产生水垢，将对管路造成严重影响。
　　在安全性上，由于真空管太阳能热水器在建筑物落成后才进行安装，热水器高出建筑物原有避雷网，雷雨天使用存在安全隐患。除了外部原因，在内部自运行中，由于真空管与水直接接触，玻璃耐冷热冲击能力差，容易造成玻璃管炸裂。另外，由于结构原因，类似紧凑式全玻璃真空管太阳能热水器，出水口比水箱底部高，因此存在一部分“死水”，此水长期处于较温暖环境，且水箱与大气相通，容易滋生细菌及微生物，影响热水水质，威胁人体健康。而平板式太阳能集热器则不存在以上问题。
　　在其它性能方面，真空管与平板系统也各有优劣。空晒温度：真空管250℃，适合高温加热系统使用，平板180℃，适合低温加热系统使用。承压性：真空管承压0.3Mpa以下，承压性能差，系统运行压力不易分配，运行效果差，易破碎；平板式承压0.6Mpa以上，承压性能好，系统运行压力易分配，运行效果佳，使淋浴方便。光污染：由于真空管是光面玻璃所以有光污染问题，而平板采用布纹玻璃，无光污染问题。

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